Ein typischer VerzeichnisBaum eines Linux-Systems sieht folgendermaßen aus (Details siehe auch ["FHS"]):

/

Das Wurzelverzeichnis - der Anfang aller Dinge ;) Wird auch als root-Verzeichnis bezeichnet und sollte nicht mit /root verwechselt werden.

/bin
Im Verzeichnis befinden sich ausführbare Programme für alle Benutzer. Wichtige Systembefehle wie einloggen, Arbeiten mit Dateien und Shells sind hier zu finden.
/boot

Das Verzeichnis enthält die zum Booten des Systems notwendigen Dateien (z.B. ["Kernel"] und ["BootManager"]).

/dev
Das Verzeichnis enthält traditionell alle Gerätedateien des Systems.
/etc
Im Verzeichnis befinden sich Konfigurationsdateien und -Datenbanken, die von root angepasst werden können.
/home
Das Verzeichnis enthält die Homeverzeichnisse der Benutzer.
/lib
Das Verzeichnis enthält die Bibliotheken, die zum Übersetzen und Linken von ausführbaren Maschinenprogrammen benötigt werden.
/lost+found
Wenn nach einen Systemabsturz die Struktur des Dateisystems beschädigt worden ist, wird versucht das Dateisystem mit dem Kommando fsck (file system check) zu reparieren. Dabei kann es vorkommen, dass verlorene Dateien wiedergefunden werden. Diese Dateien werden von fsck im Verzeichnis /lost+found abgelegt. Dieses Verzeichniss gibt es nur auf einem EXT2/3 Dateisystem und wird auch nur von diesen benutzt.
/mnt
Dieses Verzeichnis ist normalerweise leer und dient als Einhängpunkt für Dateisysteme, die nur vorübergehend verfügbar sind.
/opt
Dieses Verzeichnis beinhaltet optionale Dateien und Programme. ["SuSE"] benutzt dieses Verzeichnis um große Softwarepackete wie ["KDE"] oder ["Mozilla"] zu installieren. Die meisten anderen Distributionen fassen dieses Verzeichnis nicht an.
/sbin
Das Verzeichnis enthält eine Reihe von Kommandos, die für die Konfiguration des Systems notwendig sind. Ihre Ausführung ist meistens Root vorbehalten.
/tmp
In diesem Verzeichnis, das für alle Benutzer frei beschreibbar ist, können Zwischendateien angelegt werden. Dieses Verzeichniss ist nach dem ["FHS"] nicht persistent, alle Dateien können beim booten gelöscht werden.
/usr

Das /usr-Verzeichnis liegt bei vielen Konfigurationen auf einer gesonderten Festplatte oder Partition. Es enthält eine Reihe von Unterverzeichnissen, die weitere Anwenderprogramme, Systembefehle, Zusatzdateien und Subsysteme enthalten. Entgegen häufig geäußerter Meinung steht /usr nicht für "user" sondern für "Unix System Resources".

/var
Veränderliche Dateien hat man nach /var verlegt. Dadurch wird ermöglicht, den /usr-Dateibaum nur-lesbar in ein Netzwerk zu exportieren und zwischen mehreren UNIX-Systemen zu teilen.
/var/spool
Verzeichnis in dem der Druckerspooler, das Mailsystem und das Newssystem sowie andere Hintergrundprogramme ihre Zwischendateien ablegen.
/var/tmp
Ähnlich wie /tmp nur ist es nach ["FHS"] persistent, alle Dateien müssen einen Reboot überstehen